История психиатрической помощи в г. Сургуте начинается в 1970 году с момента открытия первого психиатрического кабинета на базе Центральной районной больницы (ЦРБ). Затем были выделены первые 15 коек для стационарного лечения больных психическими расстройствами. Психоневрологический диспансер (ПНД) как отдельное подразделение ЦРБ был организован в 1980 году и рассчитан был на 65 коек. Альфред Иванович Шмидт стал первым главным врачом диспансера, проработав на этой должности до 1983 года. На посту главного врача его сменил Александр Давидович Мишкинд, который руководил работой сургутских психиатров и наркологов до 1990 года.

В 1990 году Сургутский психоневрологический диспансер переехал из деревянного строения барачного типа в капитальное пятиэтажное здание, где были размещены все подразделения диспансера. Тогда же Сургутский психоневрологический диспансер становится самостоятельным муниципальным учреждением здравоохранения, отсоединившись от ЦРБ. В том же году диспансер возглавил Сергей Альбертович Смердов, который руководил учреждением до 2012 года. В 1993 году было открыто первое в Ханты-Мансийском автономном округе - Югре специализированное отделение для лечения пациентов с наркотической зависимостью.

В начале 1998 года организовано первое на Севере Тюменской области детско-подростковое психо-наркологическое отделение. Это позволило оказывать психиатрическую и наркологическую помощь детям и подросткам не только города Сургута и Сургутского района, но и городов Нефтеюганск, Пыть–Ях, Лангепас и других населенных пунктов автономного округа.

Благодаря усилиям руководства в 1999 году в Сургуте была организована психотерапевтическая служба. Она представлена амбулаторным психотерапевтическим отделением «Психогигиеническая консультация».

В 2000 году Сургутскому психоневрологическому диспансеру был присвоен статус клинического, а в 2006 году диспансер получил статус учреждения Ханты-Мансийского автономного округа – Югры.

В июле 2007 года Сургутский клинический психоневрологический диспансер получил грант Губернатора Ханты-Мансийского автономного округа – Югры в номинации «Лучшее лечебно-профилактическое учреждение в автономном округе». С 1 августа 2007 года организуется работа отделения наркологических экспертиз (единственного в автономном округе) с круглосуточным проведением медицинских освидетельствований на состояние опьянения.

В 2011 году после масштабной двухгодичной реконструкции введен в эксплуатацию корпус по улице Профсоюзов 12/3, в котором расположилось детское психиатрическое отделение, осуществляющее стационарную и амбулаторную психиатрическую и наркологическую помощь детям автономного округа. Кроме того, в здании расположилась администрация учреждения.

В 2012 года медицинская организация меняет тип учреждения и становится казённым. С января 2012 года руководство медицинской организации возглавил Андрей Петрович Новиков. В 2013 году главный врач КУ ХМАО-Югры «Сургутский клинический психоневрологический диспансер» А.П. Новиков был назначен главным внештатным специалистом психиатром-наркологом Департамента здравоохранения Ханты-Мансийского автономного округа - Югры и в этом же году медицинская организация стала головным учреждением наркологической службы автономного округа. Помимо психиатрической, наркологической медицинской помощи населению, учреждение проводит организационно – методическую работу с медицинскими организациями автономного округа, оказывающими наркологическую помощь населению.

В 2016 году на основании распоряжения Правительства Ханты-Мансийского автономного округа - Югры от 30.10.2015 № 621-рп «О создании некоторых медицинских бюджетных учреждений Ханты-Мансийского автономного округа – Югры путем изменения типа казенных медицинских учреждений Ханты-Мансийского автономного округа – Югры и внесении изменений в отдельные распоряжения правительства Ханты-Мансийского автономного округа - Югры», создается бюджетное учреждение Ханты-Мансийского автономного округа – Югры «Сургутская клиническая психоневрологическая больница» путем изменения типа казенного учреждения Ханты-Мансийского автономного округа - Югры «Сургутский клинический психоневрологический диспансер».

На сегодняшний день деятельность Сургутской клинической психоневрологической больницы направлена на оказание специализированной психиатрической, наркологической медицинской помощи населению автономного округа. Дополнительно в практическую деятельность внедряются современные методы оказания медицинской помощи, также реализуются мероприятия по укреплению здоровья населения и формированию здорового образа жизни. Сохраняя лучшие традиции и уникальный опыт, больница оказывает медицинскую помощь на высоком уровне уже более тридцати лет.